闇との决戦から二年。ブルードラゴンを失ったシュウは、ブーケ、レゴラスと共にレジスタンスを组织し、ロギ率いるローゼンクロイツといまなお戦っていた。そんなある日、突如空から谜の物体が降って来る。シュウとブーケが巨大なクレーターが出来た现场へと駆けつけると、そこにノイという少年が现れる。ノイは何故かシュウの事を影使いだと知っており、见下したような口调で「すぐに杀されてしまう」と告げる。そんな中、ノイを追うように巨大ドラゴンが现れ、突然、攻撃を仕挂けてくる。絶体絶命の危机。だがそのとき、ノイの能力によって、シュウの影から再びブルードラゴンが出现する。